La prima squadra maschile ha conosciuto importanti momenti nella sua storia, raggiungendo il massimo splendore negli anni ’60 e ’70, quando militava in Serie A. Il Varese ha totalizzato 7 stagioni nella massima serie, vincendo numerose partite di prestigio e diventando un punto di riferimento per il calcio lombardo. La squadra ha collezionato oltre 2500 partite ufficiali e ha segnato più di 3000 gol nella sua storia. Oggi, con una nuova gestione, il Varese punta a tornare ai massimi livelli del calcio italiano.